Płyta główna Supermicro MBD-X11DAI-N-O ma format E-ATX i wymiary fizyczne 12" x 13" (30.48 cm x 33.02 cm). Obsługuje dwa procesory Intel Xeon Scalable i Intel Xeon Scalable 2. generacji z gniazdami LGA-3647 (Socket P).
Jeśli chodzi o wbudowane urządzenia, płyta główna wykorzystuje chipset Intel C621 i kontroler Intel C621 dla 10 portów SATA3 (6 Gb/s) z obsługą RAID 0, 1, 5, 10. Posiada również układ graficzny ASPEED AST2500, dwa kontrolery sieciowe C621 GbE oraz złącza USB 3.2 Gen1 i Gen2.
Płyta główna posiada 4 sloty PCIe 3.0 x16, 2 sloty PCIe 3.0 x8 oraz interfejs M.2 PCIe 3.0 x4 dla zwiększenia możliwości rozbudowy. 32 MB AMI SPI Flash ROM bios zapewnia stabilne i niezawodne działanie systemu. Dodatkowe korzyści obejmują obsługę technologii Node Manager, ochronę przed przegrzaniem procesora i wykrywanie włamań do obudowy.